初代机造出来后，加利略的小组经过总结经验后，不到两个月的时间内又造出了二代机，效果虽然比初代机好了不少，但因无法有效解决密封持久问题，还是不太理想，他们曾经试过牛皮、羊皮与猪皮等动物皮革来制作密封圈，虽有一定效果，但没过多长时间就会破损，而且高温高压下，容易变软变形。
至于棉花与布料等物，虽有比皮革稳定性好一点，但密封效果却不太理想。
二代机之后，经过改进又造出了三代机，效果比二代机有所提升，但提升的空间并不是很大，主要还是密封问题一直无法解决，仍然一直处于实验机状态，无法给实验室附近的火器工厂使用。
直到尼德兰与大小弗朗机人将橡胶卖给四海商行后，在朱由校的提示下，他们先对初加工的橡胶进行了硫化处理，做成了符合工业用途的橡胶制品，在三代机上面经过多次试验后，终于解决了密封不严实的问题。
至于橡胶原材料，虽然这次的泰西人带过来了不少，但总有用完的一天，而且橡胶树苗从栽种到收割橡胶也需要七八年的时间，但大明的工业发展可等不了七八年，毕竟七八年之后伽利略等人与朱由校的年龄也会跟着上升七八岁，更何况朱由校都不确定七八年之后自己是否会驾崩于意外，而当自己驾崩后，蒸汽机等先进机械设备与格物院很可能会被疯狂报复的文官集团视作奇淫技巧给破坏殆尽。
对此，朱由校除了给朱常浩极少量的橡胶制品用来制作自行车轮胎外，其它的全部交给御用监用来制作蒸汽机的密封圈，与此同时，还让四海商行继续高价采购橡胶原料与橡胶树，争取在泰西人反应过来之前囤积足够多的橡胶与种植足够大明工业使用的橡胶树。
为了对橡胶与蒸汽机保密，朱由校不仅让蒸汽机小组全部转移到西山工坊区，而且制作出来的蒸汽机也只是给西山火器工厂使用，用来加快后膛线膛枪的制作速度，争取在隆武五年前让禁军所有将士都能使用上后膛线膛枪。
至于蒸汽机小组，朱由校并不会因为他们造出来了能投入工业使用的蒸汽机就给解散了，而是让他们继续研究能搭配火器工厂、织布机与纺纱机、矿山开矿与抽水、炼钢厂转炉等设备的动力问题。
除此之外，朱由校还单独成立了蒸汽机车与蒸汽轮船的研究小组，有了这两个交通工具，大明交通的速度将能得到质的飞跃，而且还能与泰西诸国迅速拉开差距。
此时的泰西诸国，貌似还在因信仰问题，正在进行持续三十年的宗教战争，等他们打完，大明说不定已经率先完成了第一次工业革命也说不定。
至于蒸汽机车的研究场所，朱由校依然选择留在了西山工坊区内，虽然需要从滦州运来大量的钢铁，但为了保密，朱由校宁可舍近求远。
虽然蒸汽机车的研究放在了西山工坊区内，但科技含量不高的铁轨与碎石块，朱由校放在了滦州钢铁厂附近，至于枕木的制作，则是放在了大沽口附近，从辽东等地海运过来的树木在大沽口卸船后，可直接加工为枕木。
对于铁轨的宽度，朱由校根据前世的大概记忆，再根据大明现在的尺寸标准，定为了四尺五寸的两条铁轨之间的距离，也就是一千四百九十八点五毫米。
铁轨与枕木在西山工坊区的实验室内确定好标准尺寸后，便开始了制作，而不是等到蒸汽机车制作出来后再去生产铁轨与枕木。
当然，为了加快碎石块的制作速度与运输效率，朱由校还让朱常浩负责的大明交通商行在卢沟河的西侧，也就是良乡的附近山区雇人制作符合标准的碎石块。
没错，以后大明的铁路建设与运营之事就交给大明交通商行了，随着大明百姓的生活越来越好，愿意送自家孩子入宫当宦官的家庭只会越来越少，而且朱由校也想着在哪天时机成熟后，就彻底停了阉宦的历史，服务内廷随从换成经过专门培养的女官。
大明未来的第一条铁路会发生在滦州与京城之间，它会沿着现有的水泥路分别经过开平、宝坻、香河、通州、朝阳新城、安定门、中关村，最终直达西山武学与西山工坊区。
至于为何将大明的第一条铁路定在京城通往滦州，一个是解决滦州煤铁运往京城的问题，另一个则是军事用途，滦州距离东边的山海关只有一百来公里，距离北边的迁西与喜峰口只有七八十公里，军事与经济意义十分重要。
在修通了滦州到西山的铁路后，出滦州后向东继续延长至山海关，并穿过宁远、锦州、广宁，最终到达沈阳。
与此同时，从朝阳新城出发，修通至天津与大沽口的铁路线，解决海运与漕运从天津到达京城的问题。
再之后嘛，则是开始修建贯通南北的京汉铁路，还是继续沿着原先修建的水泥路，从朝阳新城出发，穿过京城外城南城墙、卢沟桥、保定、真定、顺德、彰德、郑州、许昌、信阳、孝感，最终到达长江北岸的汉口镇。
至于其它方向的铁路线路修建，也会根据经济、军事、政治与资金等因素，次第修建。
轮船的研究方面，朱由校将研究所放在了天津大沽口，一是此地是离京城最近的出海口，二是这里有现成的天津造船厂，三是离滦州钢铁厂也不是很远，滦州钢铁厂的钢铁可从滦州沿着滦河直达大沽口造船厂，是距离、保密、船厂等因素的最优选择。
与之对应的，还有朱由校重点打造的武昌府，这里不仅有现成造船厂与发达的水运，还有大冶丰富的铁矿，也是一个十分不错的选择，但因距离京城有点远，作为未来大型造船厂的基地可以，但目前作为研究所的试验场，还是大沽口最为合适。