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热那亚人建议达瓦洛斯不要与法国人直接交战，但由于双方关系紧张，达瓦洛斯对这一建议置之不理，最终选择出击，却在塞雷索尔（Ceresole）战役中遭到失败。

多里亚积极出击，阻止了法国人利用这一机会，袭击他们在海岸的阵地。

在1544年弗朗索瓦与查理签订克雷皮和约（Peace of Crépy）后，多里亚希望能安享晚年。

然而，他的巨额财富和权力，加上侄子兼继承人吉安内蒂诺·多里亚（Giannettino Doria）的傲慢，使得他树敌众多。

在1547年，费斯基（Fieschi）阴谋试图将他的家族赶下台，吉安内蒂诺在这一事件中被杀，但阴谋者最终被击败。

多里亚对他们的惩罚极为严厉，夺取了许多阴谋者的封地。

他还被牵连到皮尔·路易吉·法尔内塞（Pier Luigi Farnese 帕尔马和皮亚琴察公爵）谋杀案中，而法尔内塞曾支持费斯基。

其他阴谋接踵而至，其中最重要的是朱利奥·西博的阴谋（1548年），但都以失败告终。

尽管多里亚雄心勃勃且手段严厉，但他始终是一个爱国者，成功抵制了查理皇帝多次希望在热那亚建立由西班牙人驻守的城堡的企图，无论是以甜言蜜语还是威胁都无法使他屈服于这一计划。

即便年事已高，多里亚的精力依旧充沛。

1550年，84岁的他再次出海，对抗穆斯林舰队。

尽管海雷丁·巴巴罗萨于1545年退役，熬走了一个强敌，但德拉古特和巴巴利亚海盗仍然构成威胁。

多里亚与门多萨一起攻占了德拉古特刚刚征服并作为基地的马赫迪亚，抓获了德拉古特的侄子赫萨尔。

次年，多里亚又加强了驻军，随后追踪并封锁了德拉古特及其20艘舰艇于杰尔巴的一个海湾，但德拉古特巧妙地逃脱了，他挖了一条水道，将舰船拖过陆地。

失望之余，多里亚对杰尔巴进行了劫掠。

1552年，一支由德拉古特指挥的100艘舰的奥斯曼舰队在庞萨战役中击败了多里亚指挥的40艘热那亚舰队。